Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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