Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RESTQ13127 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RESTQ13127 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RESTQ13127 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RESTQ13127 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RESTQ13127 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RESTQ13127 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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