Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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