Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMARCB1Q12824 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMARCB1Q12824 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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