Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms