Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYCNQ0VAF6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms