Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms