Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms