Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP1-1Q07627 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms