Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms