Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREMQ03060 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms