Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms