Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms