Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORDQ00796 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms