Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3AP98173 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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