Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMF1P82094 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMF1P82094 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMF1P82094 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMF1P82094 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMF1P82094 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms