Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRX1P78414 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRX1P78414 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms