Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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