Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP46P62068 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP46P62068 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP46P62068 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP46P62068 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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