Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms