Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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