Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSX2P58304 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSX2P58304 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSX2P58304 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms