Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms