Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23BP54727 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms