Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms