Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP12AP54707 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms