Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A1P53007 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms