Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms