Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP98P52948 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP98P52948 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms