Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GSK3BP49841 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms