Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLK1P49759 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLK1P49759 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLK1P49759 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLK1P49759 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms