Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPIAP49247 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPIAP49247 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPIAP49247 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms