Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX1P48742 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX1P48742 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX1P48742 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms