Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ME1P48163 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME1P48163 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME1P48163 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms