Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms