Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms