Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms