Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms