Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms