Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BCR-204ENST00000427791 771 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.164e-60■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LTBP4-239ENST00000622565 756 ntTSL 421.63■■□□□ 1.054e-9■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BCAT2-206ENST00000596981 569 ntTSL 411.08□□□□□ -0.645e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.737e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-207ENST00000414080 581 ntTSL 324.64■■□□□ 1.547e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-220ENST00000627232 1530 ntTSL 524.61■■□□□ 1.537e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 GAB2-206ENST00000530915 567 ntTSL 423.67■■□□□ 1.381e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.377e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 GAB2-207ENST00000534823 568 ntTSL 322.69■■□□□ 1.221e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 GAB2-203ENST00000526030 650 ntTSL 322.28■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PCYOX1L-203ENST00000505669 2323 ntTSL 1 (best)21.95■■□□□ 1.17e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-203ENST00000593946 1723 ntTSL 1 (best)21.91■■□□□ 1.17e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.097e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.057e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PCYOX1L-205ENST00000510990 582 ntTSL 421.42■■□□□ 1.027e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.917e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.887e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-210ENST00000445723 588 ntTSL 420.55■□□□□ 0.887e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.847e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.797e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.771e-14■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 IP6K1-208ENST00000498149 687 ntTSL 419.63■□□□□ 0.737e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.617e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-204ENST00000594661 2111 ntTSL 218.52■□□□□ 0.557e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PCYOX1L-206ENST00000511945 2500 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.517e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 317.8■□□□□ 0.447e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.367e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 517.16■□□□□ 0.343e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.37e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-202ENST00000593706 849 ntTSL 316.79■□□□□ 0.287e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.267e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.247e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.27e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-221ENST00000627317 767 ntTSL 516.02■□□□□ 0.167e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 CRELD1-204ENST00000414117 723 ntTSL 515.85■□□□□ 0.137e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 PNKP-228ENST00000637325 100 ntTSL 515.29■□□□□ 0.047e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.123e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.253e-9■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-14■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 513.4□□□□□ -0.263e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-235ENST00000598992 1005 ntTSL 512.88□□□□□ -0.353e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-312ENST00000628823 616 ntTSL 512.83□□□□□ -0.363e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-278ENST00000626870 851 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SIRT5-202ENST00000379250 3727 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.613e-9■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.633e-9■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-275ENST00000626677 378 ntTSL 510.89□□□□□ -0.673e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 GAB2-205ENST00000528886 543 ntTSL 410.68□□□□□ -0.71e-6■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.777e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 TAL1-205ENST00000465912 433 ntTSL 59.11□□□□□ -0.957e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 LINC00969-250ENST00000615493 712 ntTSL 58.32□□□□□ -1.083e-11■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.087e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.141e-14■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.277e-8■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SIRT5-206ENST00000606427 571 ntTSL 46.35□□□□□ -1.393e-9■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-204ENST00000392381 2833 ntTSL 1 (best)25.69■■□□□ 1.72e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-207ENST00000419227 1771 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-209ENST00000419553 582 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-205ENST00000392382 2690 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 DLG1-223ENST00000471733 2605 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.122e-16■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 RER1-206ENST00000462129 585 ntTSL 220.05■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 317.38■□□□□ 0.371e-7■■■□□ 17.9
GTF2F1P35269 SLC25A37-201ENST00000290075 1889 ntTSL 1 (best)22.77■■□□□ 1.248e-9■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-202ENST00000417331 735 ntTSL 521.75■■□□□ 1.078e-9■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.438e-9■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-204ENST00000518881 3404 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.298e-9■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-212ENST00000523930 823 ntTSL 516.72■□□□□ 0.278e-9■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-211ENST00000523883 3651 ntTSL 211.9□□□□□ -0.518e-9■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.257e-10■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 ERCC2-210ENST00000587376 817 ntTSL 517.15■□□□□ 0.348e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 MGST2-206ENST00000515137 1013 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 519.92■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 515.05■□□□□ -02e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 526.15■■□□□ 1.789e-8■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.829e-8■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 419.15■□□□□ 0.669e-8■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.449e-8■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 17.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 333.2 ms