Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBP1P32455 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBP1P32455 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms