Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKARP32238 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms