Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1CAMP32004 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms