Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms