Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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