Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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