Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms