Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms