Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms