Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms